• CRISPR可以發現癌癥的重大變化

      威康桑格研究所(Wellcome Sanger Institute)、EMBL-EBI、Open Targets、GSK及其合作者利用CRISPR技術,首次對癌癥基因融合進行了大規模分析,發現哪些基因融合對癌細胞的生長至關重要。研究小組還發現了一種新的基因融合技術,它為治療包括腦癌和卵巢癌在內的多種癌癥提供了一種新的藥物靶點。

      發表在《自然通訊》(Nature Communications)上的研究結果,為使用特定的基因融合來診斷和指導患者的治療提供了更多的確定性。研究人員表示,現有的藥物可以根據胰腺癌、乳腺癌肺癌患者腫瘤中發現的基因融合來重新利用。

      基因融合是由兩個不同的基因異常結合而引起的,在癌癥的發展過程中起著重要的作用。目前,它們被用作診斷工具,以預測特定癌癥患者對藥物的反應,以及預測預后,以評估給予患者最佳治療的結果。它們也是一些最新癌癥靶向治療的目標。

      到目前為止,研究人員已經確認了大約2萬個基因融合,但是它們在癌癥發展中的確切功能和作用仍然知之甚少。區分融合對癌癥存活有影響的和沒有重要臨床意義的。

      在對基因融合功能的首次大規模研究中,威康桑格研究所(Wellcome Sanger Institute)、EMBL-EBI、Open Targets、GSK及其合作者分析了來自43種不同癌癥類型(包括兒科癌癥和臨床需求未得到滿足的癌癥)的1000多個人類癌細胞系中的8000多個基因融合。

      研究小組對350多種抗癌藥物的細胞株進行了測試,以確定現有的哪些藥物可以用于治療可能存在基因融合的癌癥患者,并利用CRISPR作為工具來發現哪些關鍵基因融合對癌細胞的存活至關重要。

      研究小組發現,90%的基因融合在癌癥中沒有發揮重要作用。當從病人腫瘤的基因組序列推斷癌癥的原因時,這些結果應該被考慮。

      來自韋康桑格研究所的Gabriele Picco博士是該研究的第一作者之一。隨著基因組測序患者的腫瘤變得越來越常見,在考慮特定的基因融合是否會導致癌癥時,解釋數據的人必須謹慎。

      研究人員還發現了一種新的融合體,YAP1-MAML2,它對多種癌癥的進展至關重要,如腦癌和卵巢癌。

      韋康桑格研究所(Wellcome Sanger Institute)和開放靶點(Open Targets)的首席作者馬修·加內特(Mathew Garnett)博士說:我們發現了一些對癌癥存活至關重要的基因融合。這些基因變化可能為用現有藥物治療患者提供機會,也可能成為未來的藥物目標。我們發現了一種新的基因融合,YAP1-MAML2,它為包括卵巢癌在內的幾種癌癥提供了新的藥物靶點。

      研究結果還表明,包括RAF1、ROS1和BRD4在內的基因融合可能是現有藥物的靶點,這意味著對罕見亞型胰腺癌、乳腺癌和肺癌患者可能有新的治療選擇。

      Julio Saez-Rodriguez博士以前來自EMBL-EBI和Open Targets,現在在海德堡大學工作。香港治療癌癥,這項研究提供了進一步的機會,利用基因融合作為治療生物標志物,并將患者分層進行臨床試驗,可能提供更有針對性和更有效的臨床研究。

      Sanger、EMBL-EBI和GSK(開放目標合作伙伴)的研究人員之間的合作,有助于將這些研究成果轉化為新的治療方法。

      這項研究有助于建立癌癥依賴關系圖,這是一本未來精確治療癌癥的規則手冊。

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